Nhiệm kỳ 1995 – 1999:
GS. TS. Nguyễn Thúc Hải
Chủ nhiệm Khoa
(nguyên Chủ tịch Hội đồng Chức danh Giáo sư Ngành Công nghệ Thông tin, nhiệm kỳ 2014 – 2018)
PGS. TS. Đặng Văn Chuyết
Phó Chủ nhiệm Khoa
TS. Quách Tuấn Ngọc
Phó Chủ nhiệm Khoa
(sau là Cục trưởng Cục Công nghệ Thông tin – Bộ Giáo dục và Đào tạo, đến 2015)
ThS. Đỗ Văn Uy
Phó Chủ nhiệm Khoa
Nhiệm kỳ 1999 – 2003:
GS. TS. Nguyễn Thúc Hải
Chủ nhiệm Khoa
PGS. TS. Đặng Văn Chuyết
Phó Chủ nhiệm Khoa
PGS. TS. Nguyễn Đức Nghĩa
Phó Chủ nhiệm Khoa
ThS. Đỗ Văn Uy
Phó Chủ nhiệm Khoa
Nhiệm kỳ 2003 – 2008:
PGS. TS. Đặng Văn Chuyết
Chủ nhiệm Khoa
(sau là Giám đốc Trung tâm Đào tạo Tài năng – ĐHBK Hà Nội, nhiệm kỳ 2008 – 2013)
GS. TS. Nguyễn Thanh Thủy
Phó Chủ nhiệm Khoa
(nguyên Bí thư Đảng ủy, Phó Hiệu trưởng Đại học Công nghệ – Đại học Quốc gia Hà Nội, giai đoạn 2011 – 2017; và hiện là Chủ tịch Hội đồng Giáo sư Ngành Công nghệ Thông tin, nhiệm kỳ 2018 – 2023)
PGS. TS. Nguyễn Thị Hoàng Lan
Phó Chủ nhiệm Khoa
ThS. Đỗ Văn Uy
Phó Chủ nhiệm Khoa
Nhiệm kỳ 2008 – 2013:
PGS. TS. Huỳnh Quyết Thắng
Viện trưởng
PGS. TS. Trần Đình Khang
Phó Viện trưởng
TS. Nguyễn Kim Khánh
Phó Viện trưởng
TS. Tạ Tuấn Anh
Phó Viện trưởng
(2008 – 2011, sau đó chuyển công tác sang Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam)
TS. Trần Đức Khánh
Phó Viện trưởng
2011 – 2013
TS. Phạm Huy Hoàng
Phó Viện trưởng
2011 – 2013
Nhiệm kỳ 2013 – 2018:
PGS. TS. Huỳnh Quyết Thắng
Viện trưởng
2013 – 2015
(từ 2015 đến 2018, và từ 2019 đến nay là Phó Hiệu trưởng ĐHBK Hà Nội)
PGS. TS. Ngô Hồng Sơn
Viện trưởng
2015 – 2018
(từ 2019 đến nay là Trưởng Khoa Công nghệ Thông tin, Đại học Phenikaa)
PGS. TS. Trần Đình Khang
Phó Viện trưởng
(2013 – 2014, sau đó là Viện trưởng Viện Đào tạo Liên tục – ĐHBK Hà Nội, giai đoạn 2014 – 2015)
TS. Phạm Huy Hoàng
Phó Viện trưởng
TS. Trần Đức Khánh
Phó Viện trưởng
(2013 – 2014, hiện là Phó Hiệu trưởng Đại học Công nghệ Gia định)
PGS. TS. Huỳnh Thị Thanh Bình
Phó Viện trưởng
2014 – 2018
PGS. TS. Ngô Hồng Sơn
Phó Viện trưởng
(2014 – 2015, sau là Viện trưởng đến hết nhiệm kỳ)
PGS. TS. Cao Tuấn Dũng
Phó Viện trưởng
2015 – 2018